Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Vsig1Q9D2J4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Vsig1Q9D2J4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Vsig1Q9D2J4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms