Protein–RNA interactions for Protein: Q9D267

Lcn9, Epididymal-specific lipocalin-9, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn9Q9D267 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Lcn9Q9D267 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
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Lcn9Q9D267 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lcn9Q9D267 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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Lcn9Q9D267 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lcn9Q9D267 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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Lcn9Q9D267 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lcn9Q9D267 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms