Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D1F3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D1F3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9D1F3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D1F3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Q9D1F3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D1F3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D1F3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9D1F3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D1F3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9D1F3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms