Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tmem53Q9D0Z3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem53Q9D0Z3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms