Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdca7Q9D0M2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cdca7Q9D0M2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cdca7Q9D0M2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms