Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Mdm1Q9D067 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Mdm1Q9D067 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Mdm1Q9D067 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms