Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MtrexQ9CZU3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MtrexQ9CZU3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MtrexQ9CZU3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms