Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ssbp2Q9CYZ8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssbp2Q9CYZ8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.3 ms