Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ly6kQ9CWP4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ly6kQ9CWP4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ly6kQ9CWP4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ly6kQ9CWP4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms