Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rhobtb3Q9CTN4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rhobtb3Q9CTN4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rhobtb3Q9CTN4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms