Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR29

Ccdc43, Coiled-coil domain-containing protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc43Q9CR29 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc43Q9CR29 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc43Q9CR29 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc43Q9CR29 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc43Q9CR29 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms