Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH3

Ndufb5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb5Q9CQH3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufb5Q9CQH3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufb5Q9CQH3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb5Q9CQH3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb5Q9CQH3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms