Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cntnap2Q9CPW0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntnap2Q9CPW0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 210.3 ms