Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM15Q9C019 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM15Q9C019 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms