Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRC3Q9BY71 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRRC3Q9BY71 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRRC3Q9BY71 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRRC3Q9BY71 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms