Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXU9

CALN1, Calcium-binding protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALN1Q9BXU9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CALN1Q9BXU9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CALN1Q9BXU9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CALN1Q9BXU9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms