Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
SYCP2Q9BX26 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
SYCP2Q9BX26 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
SYCP2Q9BX26 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
SYCP2Q9BX26 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SYCP2Q9BX26 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms