Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC94Q9BW85 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC94Q9BW85 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC94Q9BW85 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms