Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TMEM106CQ9BVX2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TMEM106CQ9BVX2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
TMEM106CQ9BVX2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TMEM106CQ9BVX2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms