Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNRNP25Q9BV90 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNRNP25Q9BV90 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRNP25Q9BV90 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms