Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV35

SLC25A23, Calcium-binding mitochondrial carrier protein SCaMC-3, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A23Q9BV35 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC25A23Q9BV35 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC25A23Q9BV35 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms