Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TIMM29Q9BSF4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TIMM29Q9BSF4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TIMM29Q9BSF4 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms