Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf8Q99PV0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prpf8Q99PV0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prpf8Q99PV0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms