Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rrbp1Q99PL5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Rrbp1Q99PL5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Rrbp1Q99PL5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.93
Rrbp1Q99PL5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rrbp1Q99PL5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Rrbp1Q99PL5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rrbp1Q99PL5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms