Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
Pcgf6Q99NA9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Pcgf6Q99NA9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Pcgf6Q99NA9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Pcgf6Q99NA9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Pcgf6Q99NA9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms