Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tpgs1Q99MS8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tpgs1Q99MS8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tpgs1Q99MS8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms