Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BrapQ99MP8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
BrapQ99MP8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BrapQ99MP8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BrapQ99MP8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.7 ms