Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI9

Clp1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clp1Q99LI9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Clp1Q99LI9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clp1Q99LI9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clp1Q99LI9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Clp1Q99LI9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms