Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
RtcbQ99LF4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
RtcbQ99LF4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RtcbQ99LF4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RtcbQ99LF4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms