Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pagr1aQ99L02 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Pagr1aQ99L02 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pagr1aQ99L02 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pagr1aQ99L02 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms