Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ciao1Q99KN2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ciao1Q99KN2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ciao1Q99KN2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms