Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SEMA3CQ99985 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SEMA3CQ99985 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SEMA3CQ99985 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms