Protein–RNA interactions for Protein: Q99835

SMO, Smoothened homolog, humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMOQ99835 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SMOQ99835 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SMOQ99835 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SMOQ99835 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOQ99835 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOQ99835 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOQ99835 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOQ99835 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOQ99835 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOQ99835 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SMOQ99835 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SMOQ99835 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOQ99835 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOQ99835 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOQ99835 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOQ99835 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOQ99835 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOQ99835 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SMOQ99835 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOQ99835 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOQ99835 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOQ99835 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOQ99835 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOQ99835 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOQ99835 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SMOQ99835 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SMOQ99835 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMOQ99835 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMOQ99835 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMOQ99835 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMOQ99835 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SMOQ99835 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SMOQ99835 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SMOQ99835 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SMOQ99835 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMOQ99835 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SMOQ99835 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SMOQ99835 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMOQ99835 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SMOQ99835 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SMOQ99835 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMOQ99835 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SMOQ99835 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMOQ99835 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SMOQ99835 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SMOQ99835 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMOQ99835 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMOQ99835 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMOQ99835 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMOQ99835 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMOQ99835 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SMOQ99835 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMOQ99835 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMOQ99835 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMOQ99835 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SMOQ99835 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMOQ99835 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMOQ99835 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SMOQ99835 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMOQ99835 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMOQ99835 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SMOQ99835 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMOQ99835 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SMOQ99835 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMOQ99835 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMOQ99835 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMOQ99835 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SMOQ99835 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms