Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
PIK3R4Q99570 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC33.81■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC33.8■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.79■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
PIK3R4Q99570 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PIK3R4Q99570 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.7■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PIK3R4Q99570 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms