Protein–RNA interactions for Protein: Q99436

PSMB7, Proteasome subunit beta type-7, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB7Q99436 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMB7Q99436 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PSMB7Q99436 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PSMB7Q99436 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms