Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHF12Q96QT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PHF12Q96QT6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms