Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARXQ96QS3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
ARXQ96QS3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ARXQ96QS3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms