Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NEUROD6Q96NK8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEUROD6Q96NK8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEUROD6Q96NK8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEUROD6Q96NK8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms