Protein–RNA interactions for Protein: Q96MR9

ZNF560, Zinc finger protein 560, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF560Q96MR9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF560Q96MR9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF560Q96MR9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF560Q96MR9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF560Q96MR9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF560Q96MR9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF560Q96MR9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF560Q96MR9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF560Q96MR9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms