Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK2

RIPOR3, RIPOR family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPOR3Q96MK2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPOR3Q96MK2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPOR3Q96MK2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPOR3Q96MK2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPOR3Q96MK2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RIPOR3Q96MK2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RIPOR3Q96MK2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RIPOR3Q96MK2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RIPOR3Q96MK2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms