Protein–RNA interactions for Protein: Q96KJ9

COX4I2, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I2Q96KJ9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
COX4I2Q96KJ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COX4I2Q96KJ9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COX4I2Q96KJ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms