Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CELF6Q96J87 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CELF6Q96J87 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CELF6Q96J87 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms