Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NSL1Q96IY1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NSL1Q96IY1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NSL1Q96IY1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms