Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MS4A3Q96HJ5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MS4A3Q96HJ5 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MS4A3Q96HJ5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms