Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SCMH1Q96GD3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SCMH1Q96GD3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms