Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cts3Q91ZD5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cts3Q91ZD5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cts3Q91ZD5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms