Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y13

Pcdha7, Protocadherin alpha-7, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha7Q91Y13 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha7Q91Y13 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha7Q91Y13 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha7Q91Y13 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha7Q91Y13 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha7Q91Y13 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha7Q91Y13 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pcdha7Q91Y13 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdha7Q91Y13 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdha7Q91Y13 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pcdha7Q91Y13 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms