Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Chrna2Q91X60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Chrna2Q91X60 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Chrna2Q91X60 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms