Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usb1Q91W78 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Usb1Q91W78 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Usb1Q91W78 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usb1Q91W78 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usb1Q91W78 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usb1Q91W78 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usb1Q91W78 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Usb1Q91W78 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Usb1Q91W78 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms