Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIB5

Barhl2, BarH-like 2 homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barhl2Q8VIB5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Barhl2Q8VIB5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Barhl2Q8VIB5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Barhl2Q8VIB5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Barhl2Q8VIB5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Barhl2Q8VIB5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.7 ms